Em um futuro próximo, Kei passa os dias tediosos em Tokyo entre a escola e sua residência.Mas, um belo dia, sua antiga amiga de infância Hinoki se muda para a mesma escola que ele.

Coincidentemente, neste mesmo dia uma grande tragédia ocorre um dia antes da inauguração no novo parque temático subterrâneo "Bottom World", que é fechado completamente para o público. Sem querer, Kei acaba caindo em uma das estações de metrô quando volta à casa e vai parar no Bottom World, onde acaba presenciando seres humanos deformados, bonecos tomando vida, e o que mais o impressiona, um grande robô pilotado por nada menos que Hinoki. Quando ele acaba por entrar no robô e ajuda Hinoki a pilotá-lo, um grande boneco os ataca quando ficam sem energia. Estarão eles perdidos? No último momento, o misterioso Betterman aparece para salvá-los.